O trabalho diário do Centro depende significativamente de aplicações e equipamentos informáticos avançados. O Departamento de TI é formado por três secções: Desenvolvimento, Service Desk e Infraestrutura TI. 

Secção de Desenvolvimento

A Secção de Desenvolvimento projeta, cria e mantém as aplicações de TI e as bases de dados necessárias para o funcionamento do Centro.

Gere igualmente soluções e serviços de TI externos adquiridos a prestadores externos, tais como os fornecidos por outras instituições ou empresas privadas, e contribui para a sua investigação, integração e implementação no ambiente de TI do Centro.

Secção de Service Desk

A Secção de Service Desk é o ponto único de contacto para os utilizadores internos e externos para o tratamento de todos os problemas e pedidos de informação nos vários domínios das TI: hardware, software, telecomunicações e infraestrutura, Ocupa-se de todo o hardware pessoal, software e soluções empresariais para garantir uma arquitetura de TI coerente e de elevado rendimento em cada estação de trabalho.

Secção de Infraestrutura TI

A Secção de Infraestrutura TI fornece e mantém as infraestruturas de TI centralizadas que permitem ao Centro cumprir os seus objetivos e assegura que essas infraestruturas são resilientes através de um plano de continuidade e de recuperação. Supervisiona a disponibilidade e a segurança dos dados relativos ao Centro e dos dados fornecidos pelos clientes e parceiros, e gere os centros de dados e os serviços de nuvem que alojam a capacidade de armazenamento e de processamento necessária para as operações do Centro. Esta secção executa todas as suas atividades em colaboração estreita com o responsável pela proteção dos dados, o responsável pela segurança e o responsável local pela segurança informática.